中科院沈阳应用生态研究所2014年硕士研究生招生参考书目已公布，详情如下：
高等数学（丙） | [1]《高等数学》第六版（上、下册），同济大学数学系主编，高等教育出版社，2007年。 [2]《线性代数》第五版，同济大学数学系主编，高等教育出版社，2007年。 |
《生态学》 | 1、戈峰 主编,现代生态学，（第二版），北京：科学出版社, 2008版 2、李博主编，生态学，北京：高等教育出版社，2000版 |
《环境科学基础》 | 1、《现代环境科学导论》，盛连喜主编，化学工业出版社，2002年 2、《环境保护与可持续发展》，钱易，唐孝炎，高等教育出版社，2000年 |
《分析化学》 | 《分析化学》（下册），武汉大学，第五版，2007，高等教育出版社 |
《有机化学》 | 1、邢其毅《基础有机化学》(上,下册) 第三版，北京，高教出版社，2005年6月（邢其毅等《基础有机化学》(上,下册) 第二版，北京，高等教育出版社，2003 年3月印也可以作参考书） 2、伍越寰《有机化学》第二版，合肥，中国科技大学出版社， 2002年9月 |
《环境化学》 | 1、《环境化学》，南京大学出版社，王晓蓉编著，1993 2、《环境化学》，高等教育出版社，戴树桂，1997年3月第一版，2004年2月第九次印刷 |
《生物化学》（甲） 《生物化学》 | 《生物化学》上、下册 王镜岩等编著，高等教育出版社 （2002年第三版） 《基因VIII》（中文版），Benjamin Lewin，科学出版社 |
《微生物学》 | 1.闵航主编 微生物学(第一版 普通高等教育十一五国家级规划教材), 浙江大学出版社, 2011. 2.张利平主编 微生物学(生物科学专业6+X简明教程系列), 科学出版社, 2012. |
《自然地理学》 | 1、伍光和、田连恕、胡双熙、王乃昂，自然地理学（2000年第三版），北京：高等教育出版社。 2、黄秉维 等，现代自然地理，北京：科学出版，1999 |
《土壤学》 | 1、黄昌勇主编．土壤学（面向21世纪课程教材）．北京：中国农业出版社，2000 2、朱祖祥主编．土壤学上、下册。北京：农业出版社，1983 |
《植物学》 | 1、周云龙主编. 植物生物学. 北京：高等教育出版社，1999 2、陆时万、徐祥生、沈敏健等编《植物学》，上册，1992，第二版，高等教育出版社。 3、吴国方、冯志坚《植物学》下册 1992，第二版，高等教育出版社。 4、杨继、郭友好、杨雄、饶光远等编，植物生物学，北京，高等教育出版社。 |
《农业生态学》 | 骆世明主编(面向21世纪教材)，2001年3月版,中国农业出版社。 |
《植物生理学》 | 1.潘瑞炽等主编，植物生理学（第七版），北京：高等教育出版社，2012 2.武维华 主编, 植物生理学（第二版）, 北京：科学出版社，2008 3.高俊凤 主编，植物生理学实验指导，北京：高等教育出版社，2006 |
《景观生态学》 | 肖笃宁、李秀珍等编著，2003年版，科学出版社。 |
《森林培育》 | 沈国舫主编，中国林业出版社，2001年。 |
《气象学》 | 贺庆堂主编，北京，中国林业出版社，1988年出版。 |
《遗传学》 | 1.刘祖洞《遗传学》上、下册，高教出版社。1990年以后的版本皆可 2.AN INTRODUCTION TO GENETIC ANALYSIS（网上免费阅读http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=iga.TOC或者任何类似的大学教科书） |
《普通化学》（乙） | 1.浙江大学普通化学教研组编《普通化学》第五版，高等教育出版社，2003年。 2.华彤文、陈景祖等编《普通化学原理》第三版，北京大学出版社，2005年。 |
《森林水文学》 | 马雪华主编，森林水文学，中国林业出版社，1993年出版 |
《分子生物学》 | 《现代分子生物学》（第二版），朱玉贤 李毅著，高等教育出版社，2002年版 《Molecular Biology》(第三版)，Robert Weaver著，McGraw-Hill出版社，2005年 |
《仪器分析》 | 仪器分析（第四版），朱明华，胡坪编。北京，高等教育出版社，2008年6月。ISBN：978-7-04-023925-6 |