日前，省物价局、省财政厅核定合肥工业大学工商管理硕士培养费等收费标准。新的收费标准从2013年秋季招收的新生开始执行。
新的收费标准规定，工商管理硕士（MBA）：秋季（双证）6万元/生；春季（单证）5万元/生。公共管理硕士（MPA）：秋季（双证）5万元/生；春季（单证）4万元/生。以上收费标准为学生在校期间学费总额，按学制分学年收取，不得跨学年预收。收费标准包括实习、毕业论文（设计）等各项费用，除此之外，不得再加收其他任何费用。