为不断完善研究生教育投入机制，从2014年秋季起，内蒙古自治区将设立研究生学业奖学金，受益范围包括纳入全国研究生招生计划的全日制在校研究生，博士生每人每年1万元，硕士生每人每年8000元，博士生申报比例为50%，硕士生申报比例为30%。
从2012年起，按照国家统一部署，内蒙古自治区已设立了研究生国家奖学金、国家助学金和自治区奖学金等，其中国家助学金覆盖所有纳入全国研究生招生计划的全日制在校研究生，也就是每个研究生都能获得，标准为博士生每人每年1.2万元，硕士生每人每年8000元;国家奖学金和自治区奖学金奖励给在校表现优异的研究生，每年共900人受益，奖金最高额度3万元。