在社会就业大潮的涌动之下，名校的毕业生或许也难就业，但是热门科研院所的毕业生的前途就可以用不可限量来形容了。比如就读财政部财政科学研究所，那么进财政部工作的机会就非常的大;就读商务部国际贸易经济合作研究院，那么进商务部工作的机会就非常的大;而中国人民银行研究生部(现在的清华大学五道口金融学院)在国内被称为银行行长和银行家的摇篮。科研院所尤其是独立研究院所，是行业中的科研单位，研究人员和行业圈子的联系和交流是广泛而密切的，在这里学习，就相当于一伸手就可以触摸到本行业的第一线，这对于积累行业人脉资源、增加实践经验和就业机会都是大有帮助的。
目前我国的独立研究院所有很多种，其中实力最强、名气最大、分布最广、数量最集中的是直属国务院的中科院、社科院两大科研系统中的各类研究所和研究中心。两大系统下属的各类研究机构遍布全国各地，几乎所有省份都设有其直属的研究机构，其中尤以北京最为集中。这两大系统是专为应对国家和社会发展的科研需求而设的，是国家的思想库和智囊团，为国家培养源源不断的研究型后备军团也是它们的重要任务之一。
另一种独立研究院所是直属国家各部委的，主要是为本部委和所属行业提供科研成果，同时也利用自身成熟而丰富的科研资源为本行业培养研究人才，如国家地震局的地球物理研究所。其中直属卫生部的中国医学科学院比较特别，它是我国唯一的国家级医科学术中心和综合性医学科研机构，与中国协和医科大学实行院校合一的管理体制，医科院为协和医大提供雄厚的师资和技术力量，协和医大为医科院培养高层次的人才，两者相互依托，优势互补，这样教研相长的的管理模式在我国也是独一无二的。
还有一种是直属各省市相关单位的研究机构，它们的级别低一些，规模小一些，但是研究方向更灵活、更有针对性，地域性也更强。它们在向所属省市政府和相关单位提供科研成果的同时，也为各自领域培养后续的研究力量，如北京市首都儿科研究所、广西民族医药研究所等。
此外，有些同样以科研为主、不招收本科生的研究院所或研究中心是设在高校内部的，它们归属于高校，并没有完全的独立性，但具有许多与独立院所相似的性质和特点，如清华大学核能与新能源技术研究院、山东大学文史哲研究院等。