系统工程研究所成立于1978年，是教育部首批批准的系统工程专门研究机构之一，是一个以系统工程学科为核心的交叉综合学科群体。经过20多年的发展，已经成为本学科领域的国家重点建设学科之一，也是辽宁省重点建设学科之一。目前拥有1个博士后流动站、3个博士点、5个硕士点。
系统工程研究所目前拥有一支以中国工程院院士王众托教授为核心的老中青相结合的研究开发梯队，研究领域包括信息系统工程、知识系统工程、电子商务等：先后承担并完成了30多项国家自然科学基金项目（其中重点项目2项）、6项“863”项目和国家“攻关”项目、14项博土点基金项目和国家教委基金项目、以及数十项省市和大中型企业委托的项目，获得国家科技进步奖2项、省部级科技进步奖12项；信息化与管理变革研究成果的应用部门包括国家自然科学基金委员会、辽宁省科技厅、大连市相关政府部门和企事业单位等。
系统工程研究所拥有国家“211工程”重点学科及辽宁省重点学科投资建设的“系统分析与经营管理信息化”实验室、“群决策与系统集成”实验室，以及与HP-Compaq公司共同投资1000万元建立的电子商务实验室。
该硕士点指导教师：党延忠*、邓贵仕*、潘东华、那日萨、周宽久
注：标“*”者为博士生导师。
学科、专业名称（代码） 研究方向 | 招生 人数 | 考试科目编号及考试科目名称 | 备注 |
071102系统分析与集成 01 系统集成理论与方法 02 复杂系统分析 03 系统建模方法 | 5 | ① 101政治 ② 201英语 ③ 301数学（一） ④ 456数据结构与计算机 组成原理 ⑤ 472运筹学基础及应用 ⑥ 475计算机信息管理 ④⑤⑥任选 | 计算机、控制、电子、数学、物理、管理信息系统专业考生优先录取； |