生物分子与化学工程系以培养生物与化工交叉领域的复合型和研究型人才为宗旨。现有一个生物化工专业硕士点。目前拥有4名教师，包括教授(博导）1人，研究员1人,讲师2人，其中1人入选教育部新世纪优秀人才支持计划，3人具有海外留学背景。正在大力加强师资队伍建设，面向海内外招聘教师。主要研究领域为仿生膜，生物功能化界面，化学模拟氢化酶等。已经申请到包括自然科学基金在内的各类基金6项，总金额280余万。
本系积极开展对外合作，与英国利兹大学，南安普顿大学，瑞士洛桑联邦理工学院等建立了合作关系。