理论物理硕士点2005年由国务院学位委员会批准设立，从2007年开始招收研究生。
本专业主要培养具有坚实的理论物理基础和必要的数学功底，了解学科发展前沿，能够从事理论物理方面的科研教学的人才。我校研究方向有复杂体系量子物理、场论与数学物理、量子信息与量子调控、生物物理和高分子物理理论等方向。本学科近年培养和引进了一批高层次的人才，已建成了一支职称、学历、年龄结构合理，学术研究活跃，充满活力的师资队伍。理论物理学科的老师所从事的研究处在本学科前沿，取得了一批高水平的成果，在本学科领域的重要期刊如Phys.Rev.A，Phys.Rev.E，Opt.Lett.，Opt.Express，J.Chem.Phys.，Soft Matter等上发表了一批有影响的论文，形成了有自己特色的研究方向，并已培养了一批品学兼优的硕士研究生。