右江民族医学院研究生教育始于2006年，与暨南大学、广西医科大学、广西中医药大学、广西大学、广西民族大学和桂林医学院六所院校开展联合培养研究生教育，共培养博士、硕士研究生64人。培育了一批又一批德、智、体全面发展的高层次人才。目前我校招收基础医学、临床医学2个一级学科硕士学位研究生（含18个二级学科硕士学位授权点，详见专业目录），各硕士点均有良好的教学和科研环境，师资力量雄厚，科研经费充足。学校科学实验中心面积3500多平方米，拥有激光扫描共聚焦显微镜、流式细胞仪等仪器设备1132台（套）。已建立细胞生物学技术、基因组学技术、蛋白组学技术、免疫学技术、分析测试技术等医学科研实验技术平台，可满足各类医学科学研究需求。以下是右江民族医学院硕士专业介绍，现汇总如下：
| 基础医学院 | |||
| 基础医学 | 人体解剖与组织胚胎学 | 免疫学 | 病原生物学 |
| 病理学与病理生理学 | |||
| 临床医学院 | |||
| 临床医学 | 内科学 | 儿科学 | 神经病学 |
| 精神病与精神卫生学 | 临床检验诊断学 | 皮肤病与性病学 | 影像医学与核医学 |
| 外科学 | 妇产科学 | 耳鼻咽喉科学 | 肿瘤学 |
| 康复医学与理疗学 | 麻醉学 | 急诊医学 | |