水声工程专业作为一级学科—“船舶与海洋工程”下设的三个二级学科之一，主要研究水声技术的工程应用和各种水声设备的研究设计、制造。由于声波是在海水中探测目标、传递信息的有效工具，水声工程在经济建设中有着广泛的应用，本所自1987年起开展水声工程专业研究生培养工作，现已拥有该专业硕士学位授权点、博士学位授权点，形成了四个相对稳定、特色突出、优势明显的研究方向：⑴声纳总体技术；⑵信号处理；⑶传感器及声系统；⑷计量与测试技术。研究生毕业后可从事声学、电子、计算机应用及信息工程的科研、教学工作，也可在渔业机械、石油、地质、海洋仪器、医疗仪器等部门从事设计、生产和科研工作。
凡考入我所的研究生，因其导师均承担重要科研项目，攻读学位的课题和经费有保证。研究生可享用先进的科研实验室和馆藏丰富的国内外科技文献资料。
所作课题可进行广泛的文献调研、深入的分析计算、反复的实验验证。撰写的论文内容丰富、论据充足、试验可靠，被同行专业舆为质量和水平远高于高等院校。