免疫学是当今医学领域里的一大前沿学科。免疫学主要致力于探讨机体免疫功能及其调控作用，阐明抗感染、抗肿瘤及其自身免疫性疾病、免疫缺陷病和移植排斥反应等免疫病理机制，同时应用先进的免疫学技术对免疫相关疾病进行诊断与防治。
南医大基础医学院免疫学科1998年批准为免疫硕士点，2003年批准为免疫博士点，两点均在微生物与免疫学系。多年来，免疫学博士、硕士学位授予点已向国家培养了几十名硕士研究生和十余名博士生，另有多名博士、硕士正在攻读相应学位。
本学科现有教授4人，副教授1人，博士生导师3人，硕士生导师5人。教师中具备博士学位的比例已达50％，具有硕士学位的比例高达75％。该学科研究方向稳定，分别在病毒免疫、免疫调节与自身免疫病、肾脏免疫分子病理学等方面形成了较好的特色与优势，在国内具有较高的影响。近五年来，该学科承担各级课题20余项，获得科研经费210余万元，其中主持国家自然科学基金项目4项，“863”子课题3项和瑞典科学基金项目1项，省、厅级自然科学基金课题多项。在国内外发表学术论文100余篇，被SCI收录6篇。获省、部级科研成果奖5项。其中二等奖3项，三等奖3项。另获市级科技进步二、三等奖3项。此外，免疫学博士点还参编了国家级教材5部。
近五年来，微生物与免疫学系承担各级课题30余项，获得科研经费近400万元，其中主持国家自然科学基金项目10余项，“863”课题3项和瑞典科学基金项目1项，省、厅级自然科学基金课题20余项。在国内外发表学术论文100余篇，被SCI收录20多篇。获省、部级科研成果奖5项。其中二等奖3项，三等奖3项。另获市级科技进步二、三等奖3项。此外，还参编了国家级教材5部。
面向21世纪，微生物与免疫学系全体教师工有信心以更加崭新的面貌迎接未来，抓住机遇，不畏艰难，奋力向上，为基础医学院的发展贡献自己的智慧与力量。