企业管理是一门综合现代经济、管理理论与我国企业经营管理实际的应用类学科。中国药科大学企业管理专业具有悠久的历史，企业管理与医药行业的有机结合是本专业的一大特色。本专业旨在培养具有扎实的现代经济理论和管理理论基础，能够熟练地将经济和管理问题运用于市场经济实践，具有用定量和定性相结合的方法独立分析和解决实际经济管理问题的能力，同时具有较强的计算机应用能力，熟练掌握一门外语，能够胜任现代企业管理理论与方法研究，以及从事企业管理实务工作、大中型项目投资分析与管理的高级专门人才。核心课程包括现代企业理论、管理研究方法论、现代经济学、计量经济学、财务管理等。目前研究方向设有：企业战略与运营机制研究、医药技术经济与管理研究、医药产业经济与政策研究、药品生产运作与注册管理和企业经营管理与诊断咨询研究等。