东北林业大学“交通运输”专业（081201）始建于1957年，其前身为载运工具运用工程专业，曾用名“林业机械运用与修理”、“汽车运用与修理”、“汽车运用工程”、“载运工具运用工程”；1998年更名为“交通运输”专业。该专业目前拥有“载运工具运用工程”博士学科、“交通运输规划与管理”硕士学科、“载运工具运用工程”硕士学科，“交通运输工程领域”专业硕士学科、“物流工程领域”专业硕士学科，是黑龙江省普通高等学校“十一五”重点专业。
交通运输专业实行按交通运输类招生培养的模式，实行一个专业集群、两个阶段设置的人才培养模式。专业下设交通运输、车辆工程、汽车服务工程三个培养方向，交通运输专业方向培养具有交通运输领域较宽厚的基础理论、较广泛的专业知识、较强的工程实践能力，能在道路交通运输管理部门、交通运输企、事业单位和科研机构及高等院校从事交通运输管理、规划、汽车运用、科研或教学等工作的具有创新精神和研究开发能力的应用型技术人才。车辆工程专业方向培养能够在车辆工程及相关领域从事汽车设计、制造、试验、研发、生产组织与管理、教学等方面工作的应用型及应用研究型高素质专业人才，满足社会多层次需求；汽车服务工程专业方向培养具备宽泛的交通领域专业知识和实践能力，能在汽车服务工程及相关等领域从事汽车检测、诊断、维修、营销、保险、管理、科研和教学等工作的应用型及应用研究型高级专门人才；
交通运输专业教学资源丰富、师资队伍结构合理。人才培养以社会需求为导向，坚持育人为本、突出实践、注重能力、凸显特色的办学思路，最大限度地拓展学生专业知识空间、提高就业竞争能力。
交通运输专业拥有“黑龙江省道路运输协会”、“黑龙江省汽车工程学会”、“黑龙江省公路学会”、“哈尔滨交通工程学会”理事、“国家质检总局缺陷产品管理中心-汽车缺陷调查与鉴定专家”、“黑龙江省汽车维修检测协会专家”、“旧机动车鉴定评估专家”、“中国机动车安全检测模式研究小组”成员多人，是“黑龙江省教学先进单位”。此外，“黑龙江省汽车工程学会”、“哈尔滨汽车零部件研究开发中心”、“黑龙江省汽车产品质量监督检验站”等机构均挂靠在本学科专业，“中国汽车工业销售总公司和国家劳动与社会保障部”在学院设有职业技能培训基地。