土壤学专业（硕士、博士学位点090301）含土壤生物化学与环境土壤学、生物地球化学、土壤生态、土壤植物营养（化学）等四个研究方向。
土壤生物化学与环境土壤学：研究人类活动与土壤环境演化规律之间相互作用关系，研究生物与受人类干预的土壤环境之间相互作用的机理和规律及其调控途径和措施；从全球变化和土壤资源可持续利用的角度出发，以土壤有机碳、氮的生物化学转化和循环过程为核心，重点研究外源有机物料以及土壤有机质的微生物代谢过程。
生物地球化学(biogeochemistry)：主要研究碳、氮等元素在地球的大气圈、土壤圈、生物圈、岩石圈和水圈之间的循环和交换；研究这些物质循环对植物生产力和全球气候变化的影响，特别是二氧化碳的固存和其他元素（如氮、磷、硫等）对其的影响。
土壤生态学：研究土壤生物间、土壤生物与土壤非生命环境间的相互作用；土壤生物群落与土壤内部环境以及外界环境之间的能量流、物质流和信息流；土壤动物与微生物之间的相互作用；土壤生物对全球变化的响应；土壤生物多样性与生态系统功能的关系；土壤健康与农产品安全生产技术体系。
土壤植物营养（化学）：以东北地区主要土壤为对象，研究土壤作为陆地(森林、农田、草地)生态系统乃至整个生物圈的中心环节，在物质循环和能量流动中的独特作用与功能；不同植物种群及其配置对土壤物质和能量的同化量及据此提出优化植物种群配置；仿自然顶极结构的植物种群配置所需的优化土壤条件及其建立的途径与措施；土壤生态系统平衡地位的保持与提高土壤库的结构特征、构成特点；库容和通量、增大库容和通量的途径与措施；土壤生物学活性在评价土壤肥力、促进物质转化、防止土壤污染和提高化肥肥效中的作用及其有关的应用问题等。