一、培养目标
1．掌握马克思主义基本理论，坚持党的基本路线，热爱祖国，遵纪守法，具有良好的道德修养，积极为社会主义现代化建设服务，具备严谨科学态度和优良学风，适应面向21世纪的德、智、体全面发展的生物化学与分子生物学专业人才。
2．掌握生物化学与分子生物学的系统理论知识和基本实验技能，了解本领域的研究动态，基本上能独立开展与本学科有关的研究和教学工作，培养出具有独立进行专业理论研究和新产品开发的高水平研究性创新人才。学位论文应具有一定的创新性或应用前景。
3．掌握计算机的基本操作原理和方法，能熟练运用英语阅读专业文献，并达到大学英语六级或相当水平。
二、学习年限
硕士研究生的学习年限一般为2年到3年，实行弹性学制，最长时间不超过5年。若提前完成培养计划，可申请提前毕业，但学习年限不得少于2年。
三、研究方向
1．生物分子的结构与功能
本研究方向主要从事有重要生理功能的金属酶蛋白、糖蛋白和脂蛋白等生物大分子的有机化学、分子生物学、细胞生物学和免疫学等基础性研究，开展结构分析、化学和生物模拟合成及生物体内动态过程的研究,并模拟创制新的类似物,研究其在生命过程中的作用机制。研究激光与生物大分子、细胞和组织相互作用现象及其机制，从分子水平和能量角度探索脂类分子传能机制对DNA结构和糖类分子代谢的影响以及与细胞癌变的关系。实现对典型生物代谢过程，肿瘤的早期诊断，以及动植物生长状态和调控的实时光谱学监测。研究海洋生物活性物质结构、功能和活性及海洋生物资源综合利用。
2．基因工程
本研究方向主要从事重大疾病基因工程疫苗、基因工程抗体和基因诊断等方面研究工作。一方面是对引起重大疫病的病原体保护性抗原基因进行定位、分离、克隆、重组、表达，进而对研究其表达产物的免疫原性，从而研究预防和治疗疾病发生的基因工程疫苗和基因工程抗体。另一方面是从事重大疫病的基因诊断方法和试剂盒的研究。
3．微生物分子生物学
本研究方向主要是在分子水平上研究应用型微生物的遗传和变异特性、构建功能型工程菌以及微生物发酵控制机理等方面内容。一方面研究生产应用领域的微生物遗传和变异分子生物学基础；另一方面研究功能型产品生产工程菌构建；再一方面研究生产菌株产品最大化发酵条件代谢调控分子机制。
4．植物生物化学与分子生物学
本研究方向包括以下几个方面的研究内容：植物的糖类化学、脂类化学、蛋白质化学、核酸化学，植物酶的研究，植物维生素及激素研究，植物组织代谢，植物基因工程，PCR技术、RNA干扰及其在植物上的应用等。从药用植物中分离纯化生物活性成分。
四、培养方式
1．实行导师负责和指导小组集体培养相结合，课程学习和科学研究相结合的方式。
2．每位研究生在第一学年内应完成研究课题的选择和开题论证工作。由导师组对开题报告进行评审，只有评审通过的研究生才能继续论文的设计和实验工作。
3．在课程学习结束后，根据“大连大学硕士研究生中期考核筛选规定”进行中期考核。
4．学位论文应按“大连大学硕士研究生学位论文工作细则”的要求进行评审和答辩。
五、申请硕士学位资格
（一）完成培养计划所规定的全部学习任务，课程考核通过，并修满规定的学分。按照《大连大学硕士研究生中期考核筛选规定》，通过硕士研究生中期考核。
（二）学生在学期间，须在与本专业相关的核心学术刊物上至少发表一篇学术论文（第一作者；或导师为第一作者，研究生为第二作者），或出版专著（主编或参编）或申请发明专利一项（有申请号）。
六、学位论文与学位授予
① 学位论文题目应在导师指导下于第二学期末或第三学期初确定，论文选题应着重选择对国民经济和科学发展具有实用价值或理论意义的课题，应具有先进性。由硕士研究生撰写开题报告，并按学科研究方向进行开题报告答辩。
② 学位论文由硕士研究生在导师指导下独立完成。要求资料可靠，理论正确，思路清晰，对所研究专业和方向的最新成就有所了解，对所研究的课题有新的见解，并在该研究方向上有新成果。
③ 按照《中华人民共和国学位条例》和《大连大学硕士学位条例实施办法》（试行）的规定和要求进行学位论文评阅及答辩。
④ 答辩通过者，经学院学位评定分委员会讨论通过，报校学位评定委员会硕士学位评定工作分委员会批准，授予硕士学位。
七、研究生培养，教学组织管理机构
研究生培养和教学工作由学校研究生部统一管理，由学位点导师组进行培养方案制定和教学计划执行。