水工结构工程学科主要研究改造自然水域的人工建筑物及其地基基础、控制水的方式和结构、水工建筑材料、施工工艺技术和施工组织及工程应用与维修技术。
我校水工结构工程学科实验条件优越，科研成绩突出，拥有一支较高学术水平的师资队伍，具有结构工程、水利水运工程重庆市重点实验室等支撑平台。现有教授5人，副教授10人，博士5人。
近年来，本学科完成了国家“九五”、“十五”科技攻关、三峡工程、国家自然科学基金等重大课题的研究，获多项省部级科技成果和科技进步奖。在岩体渗流理论、环境岩土工程、高边坡计算理论和岩土测试新技术、加筋土结构设计理论与应用技术等方面具有鲜明的特色和优势。