计算机系统结构二级学科是主要研究软件与硬件的功能匹配，确定软件与硬件间的界面，研究计算机系统的物理或硬件结构、各组成部分的属性及相互联系。
本专业的培养目标是培养具有坚实的计算机科学理论基础和系统专业知识，具有从事高性能计算、微处理器体系结构、计算机网络技术、计算机系统安全技术方面研究和应用能力的高层次人才。
本学科的主要研究方向包括：
计算机体系结构
嵌入式系统及应用
计算机网络及应用
网络信息安全