发酵工程是一级学科轻工技术与工程专业下的二级学科。发酵工程学科是我国重点发展的高新技术——生物工程的重要组成部分，是生物工程技术产业化的关键。发酵工程是建立在细胞纯培养技术基础上，通过操纵遗传物质、调控细胞代谢关键酶和利用现代生物化工大分子分离纯化技术及其相应的现代装备，实现细胞的大规模培养以便获得各种生理活性物质的一门前沿生物高技术学科，其产业关联度涉及医药、农业、化工、轻工、食品及环保等领域。发酵工程是生物工程的核心技术，也是医药生物工程和农业生物工程实现产业化的桥梁。