研究生部硕士研究生均为金融学专业，下设四个研究方向：货币银行学、国际金融学、证券投资学和保险学。四个方向的基本课程相同，只是在个别专业课的设置上有所差别，以体现各个研究方向的特点。
研究生部的课程设置合理，既紧跟当前国际的最新实务、理论形势，又充分的体现了中国经济金融改革的方向；既符合国际惯例，又充分的考虑了中国特色。国务院学位委员会曾经对对全国财政学、货币银行学、国际金融三个专业硕士学位授予质量进行检查和评估，人行研究生部的货币银行学专业在同专业中名列第一，国际金融专业位居第二。1995年9月，研究生部执行了新的教学改革计划，充分的估计到未来数年内中国金融的走向，将金融工程、收购与兼并、投资学、公司财务等课程纳入教学内容，以满足未来中国政策分析家与管理者的需要。2000年10月，为适应我国金融体制改革的需要，紧跟世界金融创新的大趋势，研究生部学位委员会成立了专门小组来研究和指导研究生部的课程改革。
在课程设置上，研究生部非常的注重务实性，这充分的体现在研究生部特有的金融专题讲座中。每个学期，研究生部都为同学们开设专题讲座，邀请国内外各领域的专家、学者，实务工作者来校对最新的金融问题、经济问题阐述、讨论，以使同学们永远站在金融改革与发展的最前沿，对中国的现实金融问题真正深刻的洞悉。