学制为2.5年，入学后第一学年到哈尔滨工业大学攻读学位课程，我院负担培养费和住宿费，并提供研究生助学金，不收取学费。第二学年返回我院跟随导师完成课题及毕业论文。2013年招收的硕士研究生为国家计划非定向培养，完成学业者择优留院工作（解决北京市户口）。