以下是清华大学各学院2013年硕士研究生招生专业目录汇总：
| 建筑学院 | 土木工程系 | 水利水电工程系 | 环境学院 |
| 机械工程系 | 精密仪器与机械学系 | 热能工程系 | 汽车工程系 |
| 工业工程系 | 电机工程与应用电子技术系 | 电子工程系 | 计算机科学与技术系 |
| 自动化系 | 微电子与纳电子学系 | 航天航空学院 | 工程物理系 |
| 化学工程系 | 材料科学与工程系 | 数学科学系 | 生命科学学院 |
| 交叉信息研究院 | 经济管理学院 | 公共管理学院 | 五道口金融学院 |
| 新闻与传播学院 | 马克思主义学院 | 人文学院 | 社会科学学院 |
| 核能与新能源技术研究院 | 教育研究院 | 医学院 | 软件学院 |
| 美术学院 |
清华大学2013年接收推免硕士研究生办法