中国人民解放军第四军医大学是一所为军队培养高、中层次医学专门人才的全国重点大学。1959年被确定为全国首批重点大学，1995年进入军队重点建设院校行列，1997年成为国家首批“211工程”重点建设院校。
学校从1962年起开始招收研究生，是全国首批硕士、博士学位授予单位，首批临床医学、口腔医学专业学位试点单位。2000年6月，经教育部批准试办研究生院，2001年6月正式建院，2004年6月通过评估。承担着研究生招生、教学培养、学位授予、博士后管理以及学科建设、“211工程”建设等工作。
基地建设拥有国家重点学科15个、国家重点培育学科4个，国家重点实验室1个；博士后流动站7个，博士学位一级授权学科6个、二级授权学科45个，硕士学位授权学科63个，形成了以医学为主，可在哲学、经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、管理学等9个学科门类授予学位的授权体系；“长江学者”特聘教授设岗学科13个，全军医学专科中心研究所25个，全军医学重点实验室13个，还有3个国家临床药理基地，1个国家“863”细胞工程中心，1个全军临床药理基地。
导师队伍现有研究生导师416名，其中博士导师149名，导师队伍中有中国科学院院士1名，中国工程院院士3名，“长江学者奖励计划”特聘教授14名，国家“973项目”首席科学家4名，国家杰出青年基金获得者10名，国务院学位委员会学科评议组成员4名。
质量保证形成了入学选拔、课程学习、课题研究、实践活动、毕业答辩和和学位授予等系列完备的质量保证体系。近年来，积极开展研究生教育创新活动，实施“精优论文计划”，推行免试攻读硕士学位、硕博连读、直接攻博、博士课题资助、公派研究生出国项目、学位论文检测和终末评审、学术交流资助、研究生奖助学金等，人才培养质量得到进一步提升。
教育成果截至2010年6月，已为国家和军队培养了10200多名研究生，其中博士研究生2700余名。目前，在校学历研究生1400余名。获得全国优秀博士学位论文6篇、提名论文9篇。毕业生中有2人成为院士，8人成为长江学者奖励计划特聘教授，13人获得了国家杰出青年人才基金，其中多数成为了军内外医疗卫生领域的骨干和学科带头人。
新世纪新阶段，研究生院以科学发展观为指引，深入推进校党委提出的精品战略，紧紧围绕“以精优论文为突破口，全面提升研究生教育质量；以精品学科建设为龙头，全面提高学科整体水平”的工作思路，积极探索，勇于创新，为早日实现建设国际先进的研究型军医大学而努力奋斗。