地理科学院的前身史地系伴随西南师范大学建校而诞生，是学校开办最早、培养人才最多的系科之一。1950年10月12日，中央人民政府教育部同意将原国立女子师范学院与四川省立教育学院合并，更名为西南师范学院。这两个学院的史地系合并为西南师范学院史地系，1952年10月13日，教育部批准将史地系分为历史系和地理系。从此，西南地区高等院校第一个地理系在西南师范学院成立。1995年地理系经学校批准更名为“城镇与资源环境科学系”，99年3月升格为学院，名称定为“资源环境科学学院”。2005年7月经教育部批准西南师范大学与西南农业大学合并成立西南大学，2006年3月“资源环境科学学院”更名为“地理科学学院”。
地理科学学院师资力量雄厚，设备仪器先进，图书资料齐全，是国家在西南地区培养高校、中学地理师资和从事自然地理、第四纪地质、区域地理、城镇规划、土地管理、房地产经营管理、旅游开发与资源环境管理、地理信息系统应用等方面专门人才的重要基地。目前全院教职工85人；中国科学院院士1名；教授13名、双聘教授2名，副教授27名，讲师及助教21名、教辅行政人员24名；其中博士生导师6名(含2名双聘教授)，硕士生导师33名；具有博士学位的教师33名、硕士学位的23名，博、硕士学位人数占主讲教师比例的92%。学院现有各类在读学生1800余人，其中博士生16人，硕士生313人；拥有同位素质谱仪、原子吸收光谱仪、激光粒度仪、液相色谱仪、离子色谱仪、数字化仪、激光测距仪、数字经纬仪等一批先进的实验仪器和设备，各类中英文藏书1.3万册、期刊330余种。
学院下设地理科学、资源环境与城乡规划、地理信息与工程、教师教育系四个系；已有地理学博士后科研流动站、自然地理学博士点以及自然地理学、人文地理学、地理信息系统、第四纪地质学、区域经济学、土地资源管理六个硕士点和地理学一级学科硕士点，自然地理学、人文地理学被列为重庆市首批省级重点学科和地理学重庆市省级重点学科；现有地理科学、资源环境与城乡规划管理、地理信息系统三个本科专业。拥有自然地理、地理信息系统、岩溶环境三个实验室以及岩溶环境与石漠化治理、亚热带生物地理、西亚地理、区域经济、国土资源等研究所；我院科学研究涉及岩溶环境与石漠化治理、区域自然地理、区域规划、土地利用与规划、自然区划、亚热带地理、城市地理、灾害防治、环境保护、地图编制、志书编撰、西亚地理、地理教育改革等领域，为我院教学、学科建设、地方经济建设做出了较大的贡献。