计算机应用系成立于2006年9月，重组于2009年9月，由原计算机应用系和信息系统研究所组成，主要负责计算机应用专业硕士点建设，空间信息与数字工程本科专业建设，以及《C语言程序设计》和《VC++程序设计》省级精品课程建设，《数据库原理》课程建设。
现有师资力量20人，其中教授5人，博士生导师2人，副教授5人，讲师10人。具有博士学位8人，正在攻读博士学位7人。
目前的应用系以吴冲龙教授、戴光明、朱莉教授为核心的教学科研团队已经形成，全系教师正以饱满的激情和崭新的意志奋战在教学科研一线中。