经河南省教育主管部门批准，新乡医学院1996年开始招收医学检验专业三年制中专生，1999年开始招收医学检验专业三年制高职高专生，2001年开始招收五年制医学检验专业本科生。2004年8月成立医学检验系。2006年1月获得临床检验诊断学硕士学位授予权。临床检验诊断学2008年6月被评为“国家级特色专业”建设点，2008年8月被评为“省级重点学科”，2008年获省高工委、教育厅“先进基层党组织”。2009年获“河南省医学检验实验教学示范中心”建设点并荣获“河南省教育系统先进集体”。 2010年 “分子免疫学实验室”获河南省第五批高等学校重点学科开放实验室。近几年承担国家自然基金5项，先后承办了“全国医学检验专业第九届临床免疫学校际会暨学术研讨会”等国家级和省级学术会议6次，主编、参编了国家统编教材《临床检验仪器学》等29部。
医学检验系下设办公室、团总支两个行政科级机构和临床检验基础与输血、临床免疫学、临床生物化学与分子生物学、临床病原生物学、临床血液学、临床检验仪器学等6个教研室，1个综合实验室。
医学检验系在长期教学和科研实践中造就了一支实力雄厚、结构合理的师资队伍。现有专、兼职教师82人，其中教授、副教授25人，占30%。20名专职教师中具有博士学位者4人，具有硕士学位者14人，硕士以上学历者占90%。全国师德先进个人1人。省学术带头人1人，河南省教学名师1人，河南省优秀教师1人，实验教师中具有医师资格证或检验技师证者72人，优良的“双师型”教学队伍确保了临床能力的培养。中心重视青年教师队伍建设，严把“教学关、临床关、科研关”，还定期举行教学竞赛和实验比武以提高中青年教师的业务素质和实验技能，一批年轻化、专业化、知识化的高学历优秀教师担当科室负责人，发挥学术带头作用。目前承担3个层次（普通本科、成人教育本科、成人教育专科）医学检验专业的10门专业课的教学任务。
医学检验专业修业年限5年。主干学科：基础医学、临床医学、检验技术。主要课程：计算机基础、生理学、生物化学、病原生物学、病理学、药理学、诊断学、临床微生物学及检验、临床免疫学及检验、临床生物化学及检验、卫生统计、分析化学、临床检验仪器学、临床血液学及检验等。
总体培养目标：培养有理想、有道德、有文化、有纪律，德、智、体、美全面发展，具有扎实的医学基本理论知识、较强的实践工作能力和创新精神，符合《全球医学教育最低基本要求》，适应社会主义现代化建设需要的高素质医学检验专门人才。
专业培养目标：培养具有基础医学、临床医学、医学检验等方面的基本理论知识和基本能力，能在各级医院、血站、防疫部门及生物技术研发部门等从事医学检验及生物技术类实验室工作的高级专门人才。
医学检验系坚持“以人为本”的教育教学理念，坚持以教学为中心，以提高学生素质为目标，重视教育思想、教学内容、教学方法与手段的改革，承担学院教育教学改革课题4项。在实验教学中，结合现代医学、临床应用、能力要求、素质培养等，改变传统的“课前预习－课堂实验－课后学生完成报告教师评阅”的三段串行模式，强化“精讲、示例、设问、点拨、研讨、评析”六个环节衔接的新的课堂教学方式。将科学研究中的新方法、新内容直接用于实验教学中，真正做到科研促进教学，开设了设计性、综合性实验，提高学生的综合能力。鼓励引导学生参与教师的科研活动，帮助指导学生进行文献检索、课题设计、专业文献翻译、创办电子刊物等，培养学生的创新思维和实践能力。
建系以来，医学检验系以“高起点、上层次、有特色，立足河南、面向全国”为总体目标，坚持“人才为本、教学立系、科研兴系”，以学科建设为龙头，以改革创新为动力，以提高教学质量为核心，以加强内涵建设为重点，树立现代教育理念，更新教育观念，拓宽办学思路，加强教学管理，狠抓师资队伍建设，深化教学改革，努力提高教育教学质量和科研工作水平，扩大对外交流，积极探索医学检验的新模式，力争把医学检验专业办成在国内有一定影响、特色鲜明的专业。