中国古典文献学专业于1998年获得硕士学位授予权，1999年起开始招收研究生。系聊城大学首批获得硕士学位授予权的两个学科之一。学位点带头人先后为王世舜教授、李庆立教授、张文国教授。最初设三个研究方向：1.经学文献整理与研究，方向带头人王世舜教授在《尚书》、《庄子》研究方面取得丰硕成果，在学术界享有很高的声望。2.明清文学文献整理与研究，方向带头人李庆立教授出版学术著作6部，发表论文近百篇，在明清文学文献的整理与研究，尤其是谢榛研究方面取得重大成就。3.中国二十世纪古籍整理与研究，方向带头人于传勤教授出版《李泽厚美学思想提要》等著作。进入21世纪以来，硕士点重新进行整合，形成三个较为稳定的研究方向：经学文献整理与研究、中国古代文学文献整理与研究和中国古代语言学文献整理与研究。硕士点现已招生7届共43人，毕业27人均获得硕士学位，考取博士的12人。硕士点于2006年5月顺利通过国家学位办的评估验收，成绩优秀。