生物科学与工程学院成立于1999年9月，由微生物教研室与生物技术开发中心合并组建成立生物工程系，2005年更名为生物科学与工程学院。
学院设有生物工程、生物技术、生物科学、制药工程4个本科专业，在校学生860余人。其中生物工程为江西省品牌专业，生物技术专业实行与澳大利亚Newcastle University联合办学模式。学院有省级重点学科1个（微生物学），有硕士学位二级学科授权点1个，有在职攻读硕士学位授权点1个。
学院现有教职工45人，有省级教学名师1人，省青年骨干教师1人，省青年学术带头人1人，教授4人，副教授及副高职称10人，博士10人，外聘教授4人。拥有南昌市重点实验室1个，建有2个校级研究中心，拥有校内实训基地1个。拥有价值800万元的仪器设备和面积达2800m2的实验室。
建院以来，学院始终坚持以教学为中心，教学与科研共同发展，在人才培养、科学研究和社会服务方面取得优异成绩。学院有两门课程被评为省级精品课程，教研室多次被评为“三育人先进集体”，曾多次获得“全国‘五四’红旗团委”、“大学生暑期‘三下乡’社会实践先进单位”、“就业工作先进单位”等荣誉称号。近三年来，主持国家自然科学基金2项，主持省级课题12项。在统计源刊物上发表科技论文200余篇。
学院管理规范，学术氛围浓厚，教学活动丰富多彩，育人工作收效显著，在新的历史时期，我院坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，深入贯彻落实科学发展观，坚持教育创新，努力成为人才培养、科技创新和社会服务的基地，为实施科教兴国战略和人才强国战略，实现江西在中部地区崛起新跨越再创新的辉煌。