浙江省医学科学院药物研究所创建于1964年，经过四十多年的发展，已成为浙江省目前规模最大的集科研、开发、教育为一体的综合性新药研究开发机构。
药物研究所历史悠久，科研队伍齐整、仪器设备先进、学科设置齐全，现设有天然药物化学、合成药物化学、普通药理、肿瘤药理、生殖药理、临床药理、临床研究、药物制剂、药物分析等多个学科和研究室，设有药剂学、药理学两个硕士学位授予点，并设有世界卫生组织(WHO)人类生殖研究合作中心、国家药品临床研究基地、浙江省中药新药研发中心、药品中试生产车间， 2003年12月药物研究所被浙江省卫生厅确定为浙江省医学（药学）重点学科。
药物所拥有一支经验丰富、专业齐全、梯队合理的科研人才队伍，全所现有科研人员60人，其中研究员6人，副研究员及高级实验师21人，博士和在读博士生11人，博士后1人。药物所重视人才培养，积极选派科技人员到国外进修考察及学术交流，参加国内不同类型的学术交流会和学习班，鼓励中青年科技骨干在职攻读博士、硕士学位，推动了药物所人才队伍建设。按GLP要求结合学科发展改造和完善了实验室条件，仪器设备先进齐全，拥有如液质联用色谱仪、气相色谱仪、高速冷冻离心机、毛细管电泳仪、全自动生化分析仪等大型科研仪器40余台。
药物研究所近年来，先后承担完成了国家973、国家863项目、国家科技攻关、国家自然科学基金、国家中医药管理局、浙江省自然科学基金、浙江省科技厅、浙江省卫生厅等科研项目100余项，获国家、省部级奖项12项，获新药证书及生产批件10项，申报发明专利21项，其中8项已获发明专利证书，在国内外各类学术刊物上发表论文300余篇。在抓好科研开发的同时积极作好科技咨询服务工作，与国内有关的大型制药企业建立较为牢固的合作关系，近年来，签订技术转让、联合开发及技术服务合同300余项，创经济效益1800余万元。近年来成功研制开发了前列腺片、卡铂粉针、雌二醇控释贴片、石杉碱甲及其注射剂、片剂等一批疗效好、经济效益显著的新药，为我国的医药事业和人民身体健康作出了重要贡献。
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