扬州大学农学院办学历史悠久、师资力量雄厚、科研实力强大，在国内同类院校中有较大的影响。学院设有农学、作物遗传育种与应用生物技术、农村区域发展与信息技术3个系，设有农学、农村区域发展2个本科专业和农学（农业信息技术）1个专业方向。
学院有一级学科博士点1个、二级学科博士点6个、一级学科硕士点1个、二级学科硕士点7个；专业硕士学位点1个；有博士后科研流动站1个、教育部重点实验室1个、江苏省国家级重点实验室培育点1个、省级重点实验室3个和各类研究机构8个、农业部创新工程中心2个；有国家级重点学科1个、省级重点学科3个和校级重点学科4个，为中国作物学会栽培研究委员会挂靠单位。
学院拥有植物基础、作物学2个校级教学实验室，有扬州大学实验农牧场等校内实习场所和中国科学院、中国农科院、江苏农科院、上海农科院等校外实习基地19个。2010年，学院有本科生555人、全日制硕士研究生195人、专业学位硕士研究生108人、博士研究生65人、外国留学生1人。