黑龙江大学为全国首批研究生招生单位，研究生教育始于1981年。经过30年的发展历程，研究生教育已覆盖哲、经、法、教、文、史、理、工、农、管等十余个学科门类。拥有博士学位授权一级学科5个，硕士学位授权一级学科24个，硕士专业学位授权学科11个，可设置二级学科博士点54个、二级学科硕士点191个；2个国家重点学科（含培育），2个学科群、1个一级学科、21个二级学科为省级重点学科（含建设）；拥有6个博士后科研流动站，3个博士后科研工作站，研究生学科在数量上已远超过本科专业。在科学学位建设取得跨越式发展的同时，专业学位建设也在稳步发展，现有法律硕士、工程硕士、工商管理硕士、农业推广硕士、公共管理硕士、汉语国际教育硕士、翻译硕士、教育硕士、国际商务硕士、图书情报硕士、新闻与传播硕士等11个专业学位授权点。目前博士研究生在校人数236人，全日制研究生在校人数3810人，非全日制研究生在校人数937人，研究生在校总人数4659人，研究生在校生人数达到历史空前。
黑龙江大学于2006年5月在原研究生处的基础上正式成立研究生学院及其党委，2012年7月成立研究生院。基本已建成了学科门类齐全、学位层次完备、招生类别多样、办学规模较大的研究生教育体系，目前黑龙江大学研究生教育“十一五”规划工作已顺利完成，研究生教育也实现了由外延发展向内涵式发展的战略转变。研究生学院负责全校各级各类研究生招生、培养、学位、学生教育等管理工作。研究生学院的服务主体为导师、研究生和准备报考研究生的考生。研究生学院的工作定位是“以提高研究生培养质量为中心，以提供研究生教育服务为宗旨；建立科学的研究生导师遴选、培训和评估的管理体系，科学地规范研究生培养的进、培、出的管理程序，塑造和提高研究生自主创新精神和能力，努力开创基础扎实、自主创新、个性张扬、生机勃勃的研究生教育工作局面”。研究生导师队伍建设是研究生质量的基石。我校坚持“可上可下，动态管理”的管理思想，严格遴选、培训、考核管理制度，逐步构建竞争、开放、团队、有序的导师队伍优化机制。目前我校有博士生导师98名，硕士生导师669名，其中14名导师荣获黑龙江省优秀研究生导师，4个导师团队荣获黑龙江优秀研究生导师团队，建立起了一支年龄结构、学历结构、学缘结构较为合理的导师队伍。创新精神和创新能力是研究生质量的生命线。研究生学院大力推进教育创新，倡导导师自主创新，鼓励学生科技创新，坚持研究生科研奖励机制。学生活动的开展也应服务于创新精神和实践能力这条主线。我校研究生创新培养成绩斐然，我校获全国百篇优秀博士论文奖1项，获全国百篇优秀博士论文提名奖4项，研究生教师的6部著作被教育部遴选为全国研究生教学用书，申请黑龙江研究生创新科研项目145项，项目经费近百万元。思想政治教育和研究生日常管理是研究生学院工作的另一条主线。研究生学院学生管理坚持“以人为本”，将研究生思想政治教育和研究生日常管理全面纳入学校学生工作轨道，同时尊重研究生教育的客观规律，开拓视野，面向前沿，开展切实有益的学术文体活动。注重研究生学习生活感受，引导研究生的个性发展，塑造为人为学的人格情操，注重科学精神与人文精神的结合，使研究生精神面貌和整体素质再上新台阶。
研究生学院一直通过优化结构和创新机制，进一步提高学位与研究生教育质量，不断完善有中国特色、符合高层次人才成长规律的学位体系，充分发挥学位与研究生教育在现代化建设中的重要支撑作用，努力把我校学位与研究生教育工作提高到一个新的高度，新的水平。