自动化学院成立于2000年，其前身是1985年成立的机器人研究室和1994年成立的自动化系。学院现有1个一级学科博士学位授予权立项建设点、1个一级学科硕士点、5个二级学科硕士点；1个浙江省重中之重一级学科、1个国防特色主干学科、1个原信息产业部重点学科。有自动化、电气工程与自动化、电气信息工程3个本科专业，其中1个国防特色重点专业、2个浙江省“十二五”优势专业、2个浙江省重点建设专业；有1个教育部工程研究中心、1个国防重点学科实验室，是浙江省工业自动化创新平台核心成员单位；有1个国家财政部资助重点实验室、3个浙江省财政厅资助重点实验室。学院实验室总面积达4000余平方米，设备总资产5000余万元。以下是杭州电子科技大学自动化学院导师介绍，现汇总如下：
| 陈德传 | 郭宝峰 | 姜周曙 | 刘光宇 | 罗志增 | 王家军 | 肖宏飞 | 杨勇 |
| 陈华杰 | 郭云飞 | 蒋鹏 | 刘俊 | 马玉良 | 王建中 | 谢小高 | 俞武嘉 |
| 陈云 | 韩其国 | 金朝阳 | 刘士荣 | 孟明 | 王剑 | 徐伟栋 | 张日东 |
| 丁强 | 何宏昌 | 孔亚广 | 刘伟 | 彭冬亮 | 王越胜 | 徐晓滨 | 章坚民 |
| 范影乐 | 侯平智 | 赖晓平 | 刘伟峰 | 尚群立 | 文成林 | 徐哲 | 赵晓东 |
| 冯浩 | 暨仲明 | 李祖欣 | 鲁仁全 | 邵根富 | 吴开华 | 薛安克 | 周绍生 |
| 高发荣 | 江爱朋 | 厉力华 | 吕强 | 佘青山 | 吴秋轩 | 薛凌云 | 周晓慧 |
| 葛泉波 | 姜偕富 | 刘栋良 | 罗平 | 史廷春 | 席旭刚 | 杨成忠 | 周亚军 |
| 朱亚萍 | 左燕 |