管理科学与工程研究室历史可以追溯到中国科学院应用数学研究推广办公室，是著名数学家华罗庚教授创立、国内最早从事统筹法、优选法推广与应用的研究集体。
多年来，该研究室在管理科学与工程研究领域发表了大量高质量学术论文，取得了一批高水平研究成果,曾获国家科技进步奖5项（其中一等奖1项、二等奖3项、三等奖1项），省部级科技进步奖12项（其中一等奖5项、二等奖7项），培养了一大批管理科学理论和应用研究专门人才，在学术界、政府部门及企业界发挥重要作用。
该室主要研究方向包括：管理科学理论与方法、工业工程、复杂性科学、项目管理、能源与环境政策、应急管理、航空管理、金融风险管理等，并在宏观经济、能源、金融、交通等行业开展应用研究。