北京大学前沿交叉学科研究院（Academy for Advanced Interdisciplinary Studies，Peking University）是北京大学跨学科的研究平台。2005年12月28日，学校发文成立前沿交叉学科研究院（校发[2005]288号），全国人大常委会副委员长、中国科协主席、北京大学医学部主任韩启德院士担任院长，方竞教授担任常务副院长。2006年4月4日，前沿交叉学科研究院成立大会在北京大学隆重举行。时任北京大学校长的许智宏院士在研究院成立大会上的讲话中指出：“前沿交叉学科研究院的成立将是北京大学历史上十分重要的一笔，对北京大学的学科建设、科学研究发展和综合素质人才的培养等都具有十分重要的意义。”韩启德院长对研究院的发展提出了24个字的方针：虚实结合，摒弃浮躁，完善制度，项目带动，兼容并包，外向开放。
当代科学的发展和重大科学技术成就的取得，越来越依赖于不同学科之间的交叉与融合，许多有影响的科技成果，都是在学科的交叉点上取得的。近些年来，国内外许多政府机构和著名大学纷纷组织建立跨学科研究机构，支持交叉学科发展，并逐步取得各种重要成果。北京大学具有很好的基础学科和技术学科优势，学科齐全、基础雄厚是北京大学的重要特点。北京大学的多学科特点为发展跨学科研究提供了独特的优势和重要的基础条件。在“创世界一流大学计划（一期）”的支持下，北京大学已经建立了若干跨学科研究中心，为建设整体的跨学科研究平台打下了良好基础。前沿交叉学科研究院的成立，是建设整体性的跨学科研究平台的重要一步。
前沿交叉学科研究院的基本任务是组织跨学科的学术交流、开展跨学科的科学研究和培养交叉学科的优秀人才。研究院将以北京大学雄厚的基础学科和先进的技术学科为基础，组织联合相关的研究力量，建设具有良好学术交流环境、学科前沿性与学科交叉性相结合、实体与虚体相结合的交叉学科研究平台，为北京大学的交叉学科研究创造良好的学术氛围和研究条件；研究院将开展前沿性的问题研究和科学技术攻关，使北京大学在一些重要领域进入国际前列；研究院将在研究生主管部门的指导下，与相关院系和学科合作，努力探索交叉学科人才培养模式，使之成为高层次综合人才培养的重要基地；研究院的管理体制将以有利于促进学科交叉和创造良好学术氛围为基本准则，采用虚实结合、研究人员专聘与兼聘相结合等多种灵活方式，资源在校内外共享。
前沿交叉学科研究院成立以来，通过探索科研与管理机制创新、推动基础条件建设、招聘和引进优秀科研人才、组织学术交流与研究项目申请等工作，有力地促进了研究院的体制建设、学科建设和队伍建设。在前沿交叉学科研究院的框架下，各个研究中心以各自已有的条件为基础，面向科学技术发展和国家社会需求，组织多学科的研究力量开展前沿性问题的研究和科学技术攻关，获得了各类跨学科研究项目的支持，并已经取得了若干重要的研究成果。