中国少数民族经济学科自2004年石河子大学政法学院马克思主义民族理论与政策硕士点开始招生起，就做其研究方向并招收硕士研究生。2006年获得硕士学位授予权，2007年正式独立招生。在校院各方面的大力支持和和师生们共同努力下，硕士点在学科建设、人才培养和科学研究等方面都取得了较好的成绩。如硕士点专业核心课程《民族经济学》于2008年获批大学精品课建设项目，硕士点专业教材《民族经济学新论》于2008年被批准为研究生教材编写的重点支持项目。
中国少数民族经济硕士点在对中国少数民族经济理论系统研究的基础上，立足于新疆少数民族经济发展的历史和现实，重点研究在西北地区特殊的经济政治和社会区位、特殊的民族文化条件下，少数民族经济发展的特殊规律和要求，少数民族地区资源配置和民族传统产业发展等问题。硕士点注重对学生的理论研究能力、田野调查能力、科研论文写作能力等方面的培养，努力建设培养面向基层、服务于民族地区的高水平科研人才和专业人才的良好平台。
本硕士点现有两个研究方向：1.中国少数民族经济理论与新疆少数民族经济研究。该方向通过对国内外少数民族经济理论的梳理，结合新疆实际，就新疆少数民族经济发展的现实问题进行深入研究。2.民族地区资源开发与可持续发展研究。该方向主要研究在新的历史时期，民族地区经济资源的优化配置和开发利用，民族传统产业发展等问题。
目前，本硕士点导师队伍由7人组成，其中教授3人，有博士学位2人。近五年以来，承担了国际合作研究项目2项，国家社科基金项目7项，参与国家社科基金重大研究项目2项，省部级研究课题6项，校级课题8项，发表学术论文近百篇，被CSSCI、CSCD、ISTP检索收录的达20余篇，出版学术专著5部。