特种经济动物饲养学科具有硕士学位授予权。学科主要针对我国北方的特种经济动物，主要研究特种经济动物（鹿类、毛皮动物、珍禽和林蛙等）的营养和饲料开发、繁殖生理和繁殖新技术以及产品开发相关的基础和应用基础课题。学科分为特种经济动物营养与饲料科学、繁育和产品加工三个研究方向。目前主要研究鹿类饲料专用添加剂和鹿类饲料的加工以及核酸代谢机理和降人血尿酸药物筛选，益生素和新型饲料添加剂在毛皮动物（水貂、狐貉等）和特禽饲养领域的应用以及特种经济动物产品产业化。学科现有硕士导师6名，其中4人具有博士学位，2人具有硕士学位。目前承担国家自然科学基金、吉林省科技发展重点项目等国家和省部级科研项目10余项，完成国家重点科技攻关项目和省部级科研课题20余项，获得农业部科技进步奖三等奖1项，吉林省技进步奖二等奖3项、三等奖5项、吉林省政府科教兴农一等奖1项，辽宁省政府科教兴农一等奖1项。
研究生培养采取导师负责下的指导组共同负责制，导师组成员全为专职教师，有充足的时间指导研究生的试验和论文撰写工作，校内有动物室和试验鹿场及特种经济动物研究室供研究生试验研究用。