农业生物环境与能源工程是国家第八批硕士学位授权单位。1986年开始招收新能源开发与利用方向硕士学位研究生。本学科拥有董良杰、袁月明、吕铁彪等知名教授和专家，从事新能源开发与利用、农业废弃物资源化利用、农业生物环境控制与保护、农业建筑工程与环境工程、设施农业工程等方向的研究，主持和承担过多项国家和省部级科研课题，在生物质气化与液化技术、风能利用、有机废水生化处理技术和村镇住宅规划与设计等方面取得了多项成果。生态能源示范县建设工作多次受到国家、省政府和地方政府的表彰。