| 1. 赤潮浮游生物综合测量系统及分析技术（2001.12-2005.12，国家高技术研究发展计划（863）项目，2001AA635090，主持） 2. 沿海地下卤水的铀系地球化学研究（2003-2005，国家自然科学基金面上项目，40276026，主持） 3. 高混浊河口水域的生物地球化学过程（2002-2006，国家基础研究重大项目（973）中国典型河口-近海陆海相互作用及其环境效应第五课题，2002CB412405，第二负责人） 4. 基于生物标志化合物的海洋浮游藻类快速分类方法研究（2004-2006，高等学校博士学科点专项科研基金，20030423005，主持） 5. 水文生物地球化学过程及其对生态系统结构的影响（2004-2007，国家自然科学基金重大项目“大型水利工程对长江流域重要生物资源的长期生态学效应”第二课题，30490232，主持） 6. 海洋浮游藻化学分类方法研究（2005.01-2005.12，国家自然科学基金面上项目，40476044，主持） 7. 典型水域生源要素循环及浮游植物多样性对海洋物理环境演变的响应（2006-2010，国家基础研究重大项目（973）中国东部陆架边缘海海洋物理环境演变及其环境效应第五课题，2005CB422305，课题骨干） 8. 北黄海区块水体环境调查与研究（2006.01-2009.12，我国近海海洋综合调查与评价专项（908项目），908-01-ST02，项目组副组长） |