江西中医药大学倡导并践行“赢在终点”为核心的教育理念，引领人才培养模式改革与创新，先后开设了科研实践班、双惟实践班等一系列教育教学改革。拥有国家级人才培养模式创新实验区1个，教育部高等学校特色专业建设点3个，国家级精品课程2门，国家双语示范课程1门；国家中医药管理局和江西省重点学科23个。两项教学改革研究项目分别于2001年、2009年获得教育部国家教学成果二等奖。