工学院的前身为农机系。学院坚持“以‘三个代表’和‘三个面向’为指针,坚持教学科研并进,质量效益并重,充分挖掘潜力,主动适应市场,努力扩大规模,大力弘扬特色,稳步提高质量”的办学指导思想;坚持“以农业工程为特色,机械电子为主体,其他工学学科同时发展;以本科教育为主,大力发展研究生教育,适度发展高职和成人教育;立足江西,面向全国,为国家的经济发展和社会进步培养符合时代要求的复合型建设人才”的办学定位。