工学院的前身为农机系。学院坚持“以‘三个代表’和‘三个面向’为指针，坚持教学科研并进，质量效益并重，充分挖掘潜力，主动适应市场，努力扩大规模，大力弘扬特色，稳步提高质量”的办学指导思想；坚持“以农业工程为特色，机械电子为主体，其他工学学科同时发展；以本科教育为主，大力发展研究生教育，适度发展高职和成人教育；立足江西，面向全国，为国家的经济发展和社会进步培养符合时代要求的复合型建设人才”的办学定位。