广东海洋大学航海学院成立于2001年9月，现有航海技术、轮机工程（轮机管理、船舶动力方向）和交通运输三个本科专业。其中前两个专业是本校的传统学科。学院的前身是1935年创办的广东省立高级水产职业学校渔捞科，后发展为海洋捕捞、船舶驾驶、船舶动力装置、轮机管理等专业。几十年来，为国家培养了众多的航海专业人才。建国以来，已为国内外航海战线培养了专门技术人才3400多人，这些毕业生在各自战线已成为骨干力量。新中国第一位远洋船长陈宏泽就是本校的早期毕业生；1988年，英女王伊丽莎白二世访问广州时，有关部门指定的引水员也是本校的毕业生。
学院拥有1300多万元的教学、实习、科研设备；设有航海综合实验室和轮机工程综合实验室，其中，航海综合实验室设有 大型船舶操纵模拟器、GMDSS模拟器、雷达观测与标绘和雷达模拟器、自动雷达标绘仪（ARPA）等实验室，轮机工程综合实验室设有轮机模拟器、轮机管理、船舶电站模拟器、船舶电气、轮机拆装等实验室。学校十分重视航海类专业的建设，继续加大航海教学建设投入力度。
同时，随着办学规模的不断扩大，学校高度重视航海学院的师资队伍建设，制定师资队伍建设规划，采取引进、外聘以及在职提高的办法，充实航海类专业教师队伍，提高在职教师的学历层次，进一步提高航海类专业的教学质量。
航海学院肩负着航海教育与培训的重任。学院在根据我国履行实施STCW78/95国际公约的精神，积极开展教学改革，加强实践性教学环节，抓紧航海教育质量体系建设工作，为我国航运事业培养无限航区高级航海专业人才的培养目标而努力的同时，积极开展海渔船船员培训工作，为进一步提高海渔船船员的业务技术水平，加快航运事业的发展作出了积极的贡献。
航海学院毕业生深受用人单位欢迎。近年来，一次性就业率都在百分之九十左右。2008年，毕业生一次性就业率达百分之九十五。