中国海洋大学的以下实验室为教育部重点实验室：
物理海洋教育部重点实验室
海洋药物教育部重点实验室
海水养殖教育部重点实验室
海洋环境与生态教育部重点实验室
海洋遥感教育部重点实验室
海洋化学理论与工程技术教育部重点实验室
海底科学与探测技术教育部重点实验室