管理科学与工程学院于2003年8月由我校机械工程学院工业工程、计算机学院信息管理与信息系统、管理学院物流工程等三个专业合并组建而成。管理科学与工程是管理学科群与工程学科交叉、融合、创新的重要生长点和发展区，是与机械工程、计算机技术、物流管理、社会经济、系统工程等方面密切联系，有成果有特色有亮点的学科。
管理科学与工程学院拥有一支教学经验丰富、科研能力较强，梯队结构较合理，勇于创新，生机勃勃的师资队伍，现有教师44人，其中教授7人，副教授6人，讲师22人；硕士生导师12人。教师中具有博士后学位1人，博士学位6人，在读博士5人，硕士研究生以上学历的教师占教师总数的73.6%。现有在校本科生1098人，硕士研究生12人。聘请教育部管理科学与工程教学指导委员会主任、中国机械工程学会工业工程学会主任、天津大学管理学院院长、博士生导师齐二石教授等国内外著名管理专家为兼职教授5名。
学院现设有“管理科学与管理工程”一级学科硕士点，“工业工程”在机械工程学科下招收工业工程工程硕士。现有“工业工程”、“信息管理与信息系统”和“物流工程”三个本科专业，为国家培养了大批工程管理中高级管理人才。
学院下设 “工业工程系”、“物流工程系”和“信息管理与信息系统系”等教学机构，设有安徽工业大学工业工程研究所、安徽工业大学物流工程研究所、信息管理研究所，并设有两个研究中心（ERP实验中心、管工人文与创新教育中心），二个实验室（生产系统实验室、人因工程实验室）。
管理科学与工程学院秉承“明德厚学，沉毅笃行”的办学院训，“奋发进取，忠诚精实”的办学精神，坚持“立足安徽，面向经济”的办学方向；培养“素质综合，能干实干”的高级专业人才。
学院重视加强学科建设责任制，明确院党政领导，学科、学术带头人、骨干教师和系、研究所、中心负责人在学科建设中的目标、任务、权限和责任，大力加强硕士点建设和研究生教育工作，把研究生培养工作作为学科建设的重要手段之一。
管理科学与工程学院结合我国国情，紧密结合和依托安徽工业大学的工科学科优势和工程专业学科优势，明确学院的战略定位，确定学院的发展目标，科学规划，突出教学，深化实践环节，在探索培养社会急需的德智体全面发展的高级工程技术应用人才方面取得了一定的成绩。
学院十分注重教学工作，在提高教学质量、教学方法和教学内容的改革、专业建设、课程建设等方面均取得了较大的成绩，几年来，有两项教学研究成果获省级教学成果奖二等奖。《物流工程》获得了国家级精品课程称号，《创造学与创新能力开发》获省级精品课程。《电子商务》、《管理信息系统》和《生产管理》。获校级精品建设课程。
管理科学与工程学科经过建设，已初步形成了“工业工程”、 “信息管理与信息系统”和“物流工程”三个较为稳定、具有鲜明特色、富有成果的研究方向。近几年来，承担国家、安徽省自然科学基金项目、安徽省科技厅科学计划项目及各类课题55项，科研总经费达300多万元，有10余项成果获省部级以上奖励；发表学术论文200多篇，其中被SCI、EI、ISTP收录10余篇；出版重要的学术专著及教材2部；通过省部级鉴定的科研成果20余项。同时，学院注重教学研究建设，先后投资200多万元建成了先进的ERP学科研究实验室、信息实验室、工业工程生产系统实验室和藏书丰富的学科资料室，为教学、科研、重点学科建设和发展提供了有力的保障，也创造了优越的人才成长环境。学院培养的学生综合素质高、学生学术活动活跃，毕业生因知识面广、适应性强而深受用人单位欢迎。
学院始终瞄准“厚基础、宽口径、高素质、强能力，具有创新精神和创新能力的复合型、应用型人才”的办学目标，在专业教育的基础上，积极开展素质教育，推行创新教育，创办“创新能力试点班”和“三个一百”活动。构筑第二课堂教学平台，通过第二课堂科技文化活动、本科生导师制、科研工作经历、创新教育讲习会、角色扮演、社会实践等活动与第一课堂相辅相成，切实培养创新型人才。大学生已申请专利54项，并荣获第二节安徽省“挑战杯”科技作品竞赛一等奖。