生态学是我校重点学科之一，拥有理学硕士学位授予权。设有生态与气象、环境生态学、信息生态学3个专业研究方向。 本专业研究内容主要针对生态与气象、环境生态学、信息生态学、城市生态学等领域，应用现代生态学原理，结合生态学研究的若干前沿与热点问题，开展广泛的多学科综合交叉研究。目前，本专业拥有硕士生导师8名，其中教授4名，副教授4名，博士7名。该专业承担和完成了多项国家级、省部级、厅局级以及国际合作科研课题，在本领域取得了显著的研究成果，积累了丰富的研究经验和资料，形成了自己的特色，发表论文百余篇，出版专著3部。该学科建立了农业气象与生态学试验站，购置了液相色谱、气相色谱、离子色谱、定量PCR仪、光合作用系统、冠层分析仪、酶标仪、电脑高清图像显微系统等一批先进科研设备。
本专业学制3年，对提前完成培养计划要求的学生允许提前半年毕业。主要课程：自然辩证法、英语、高级生态学、现代生态学研究进展、环境生态学、生态气象学、 信息生态学、植物生理生态学、生态工程学等。 毕业生可从事环保、气象、农业、林业等部门的行政管理工作、高等院校教学科研工作、科研单位及生产部门的科技工作，各层次的生态规划、生态工程的设计和建设工作。