机械工程学院现设有三系一部一室：机械工程系、农机工程系、动力工程系、工学基础教学部、机械工程实验室。有四个本科专业：机械设计、制造及其自动化专业、农业机械化及其自动化专业、交通运输专业、热能与动力工程专业，其中机械设计、制造及其自动化专业是省级重点专业，有两个专科专业：包装工程专业、机动车检测专业。
有一个省级重点学科：机械制造及其自动化学科，该学科是大学第一个工学硕士授权点，并设有电加工、工程技术、液压传动、农业机械等四个研究所。学院现有学生1800余名，有教工160余名，其中教授7名，副教授40余名，具有硕士学位或硕士研究生以上学历的教师20多名。教师中有全国优秀教师、省劳动模范、市劳动模范、市十佳青年、大学双十佳教师等，组成了一支高学历、高职称、高素质、年轻化、知识化、革命化结构合理的教师队伍。
经过几十年的发展与建设，机械工程学院集中了佳木斯大学工科诸多资源，教学科研设备先进，探索了一整套教学、科研和管理工作的新思路、新方法，不断深化素质教育，增强教师和学生的创新意识，创造能力，取得了突出成绩。近几年来，学院获省、部级科技进步奖4项，省优秀教学成果奖4项，市科技进步奖5项。闫兆平教授九五攻关项目——高速列车用新型推力向心滚动轴承已获得国家专利。现正在进行的科研项目中，有国家、省自然科学基金资助项目3项，省科委攻关项目2项。
在大学党委和学院党委的领导下，全院师生正锐意进取，奋发向上，团结、奋进、求实、创新，为把机械工程学院早日建成佳木斯大学一流学院而努力拚搏。