网络与计算机部主要职责是为预报业务和科研提供高性能计算机和网络的支持与维护服务。
具体职责包括负责全球海洋水文气象资料、海洋站、船舶、浮标、雷达站和传真资料等的实时收集及全国海洋预报系统实时资料的分发工作；负责VSAT系统的运行管理；承担全国海洋环境预报业务系统和网络的建设、运行、维护和管理；高性能计算机系统的运行、管理、维护、应用平台开发及用户技术支持；中心局域网络和电子邮件系统的运行、管理和开发；负责中心网站、内部办公网的制作、管理和维护；负责组织全国海洋预报、灾害预测会商及远程视频会商系统的运行和维护；承担各类预报用图的接收、填绘、预警报产品的分发及该系统设备的管理和维护；承办中心领导交办的其它事宜。
网络与计算机管理部下设5个组：高性能计算机组（简称计算机组）、网络组、数据通讯组（简称通信组）、远程视频会商组（简称会商组）和预报发送组（简称发送组）。