区域与城市生态环境保护研究创新基地
重点研究方向：
· 生态监测与评价方法：包括遥感、地面监测方法与数据管理，生态质量评价的理论与方法。
· 生态结构与过程：包括景观生态系统结构与过程，非点源污染过程与控制。
· 生态系统服务功能：包括生态系统服务功能辐射效应，生态服务功能的评价、服务机制，区域生态补偿机制。
· 生态规划与设计：包括区域、流域生态功能分区与规划理论、重要生态功能区保护规划理论与方法，生态园区规划与设计。
环境变化的生态效应研究创新基地
重点研究方向：
· 大型工程与区域开发的生态影响：包括生态风险综合评价，生态系统对生态胁迫的应急反应与自我恢复力，退化生态系统演化规律及恢复重建技术。
· 生物多样性保护与生物安全：包括生物多样性评估与监测技术，转基因生物安全评价，外来物种生态效应评价与防治技术，自然保护区与设计技术。
· 全球变化对典型生态系统结构与功能的影响