固体废物处理处置技术研究创新基地主要研究领域：
固体废物与危险废物特性鉴别、固体废物填埋技术、填埋场渗漏检测与污染探测技术、污染场地勘探与修复、固体废物无害化处理和资源回收利用技术、固体废物管理政策、规划与标准等。
水污染控制技术研究创新基地重点研究方向：
水环境中污染物的迁移、转化机理，工业废水污染防治技术和对策，水污染物生物降解机理，水污染控制微生物学，化肥、稀土、酿造、味精、造纸、印染、染料等高污染行业废水处理技术，城镇污水处理与资源化技术，污水处理厂剩余污泥减量资源化，垃圾渗滤液的安全处置技术，微污染水生态净化技术，水污染控制新材料和设备研发，污水回收回用关键技术，农村集约化养殖废水污染控制技术以及畜禽养殖污水和粪便中营养元素回收和循环利用工艺技术等。
大气污染控制技术研究创新基地
重点研究方向：
半干半湿法烟气脱硫除尘技术、微细粒子控制技术、燃煤锅炉烟气汞排放控制技术、氮氧化物控制技术、干法/半干法烟气脱硫副产物的资源化利用技术以及SO2/NOx/汞等多污染物一体化净化技术等。