南京医科大学基础医学院下设14个系、2个教研室、1个国家级实验教学示范中心(基础医学)。现有1个博士后流动站、1个一级学科博士点、10个二级学科博士点, 3个一级学科硕士点、16个二级学科硕士点。查字典查字典考研网现将该学院硕士导师介绍汇总如下：
| 丁勇 | 高兴亚 | 季勇 | 朱昌亮 | 祝辉 |
| 吴小玲 | 杨俭 | 徐涌 | 陈云 | 李荣凤 |
| 邓小昭 | 李庆平 | 陈琪 | 周洪 | 周作民 |
| 袁栎 | 李菁 | 唐家琪 | 卢春 | 沙家豪 |
| 王婷 | 戚晓红 | 季旻珺 | 季晓辉 | 肖明 |
| 徐珊 | 李皓 | 王勇 | 王迎伟 | 丁炯 |
| 曹新 | 赵子建 | 苏川 | 邓国民 | 苗登顺 |
| 戈应滨 | 李跃华 | 管晓虹 | 霍然 |