硕士生导师，研究员
E-Mail：juncai@big.ac.cn
研究领域：基因组学/生物信息学
学习经历：
学习经历1995年9月-1999年7月清华大学自动化系学士1999年9月-2005年7月清华大学生物信息学博士
工作经历：
2006年-2008年美国伊利诺伊大学香槟分校生物工程系博士后
2009年-至今中国科学院北京基因组研究所研究员
研究方向：计算生物学和变异基因组学
近期主要学术成果：
1.CaihongZheng,XuexiaMiao,YanenLi,YingHuang,JueRuan,XiMa,LiWang,Chung-IWu,JunCai,Determinationofgenomiccopynumberalterationemphasizingarestriction-sitebasedstrategyofgenomere-sequencing,Bioinformatics,doi:10.1093/bioinformatics/btt481,2013.
2.LanJiang,JingZhang,Jing-JingWang,LuWang,LiZhang,GuoqiangLi,XiaodanYang,XinMa,XinSun,JunCai,JunZhang,XingxuHuang,MiaoYu,XuegengWang,FengLiu,Chung-IWu,ChuanHe,BoZhang,WeiminCi,JiangLiu.Sperm,butnotoocyte,DNAmethylomeisinheritedbyzebrafishearlyembryos,Cell,2013,153,773-84.
3.QiangGong,Yongtao,Jian-rongYang,JunCai,YunfeiYuan,etal.,Identificationofmedium-sizedgenomicdeletionswithlowcoverage,mate-pairedrestrictedtags,BMCGenomics,doi:10.1186/1471-2164-14-52,2013.
4.YongTao*,JueRuan*,Shiou-HweiYeh*,XuemeiLu*,YuWang*,WeiweiZhai*,JunCai*,etal.,Rapidgrowthofahepatocellularcarcinomaandthedrivingmutationsrevealedbycell-populationgeneticanalysisofwhole-genomedata,PNAS,doi:10.1073/pnas.1108715108,2011.(*contributeequally)
5.JunCai,DanXie,ZhewenFan,JohnMarden,WingH.Wong,ShengZhong.Modelingco-expressionacrossspeciesforcomplextraits:insightstothedifferenceofhumanandmouseembryonicstemcells.PLoSComputationalBiology,6(3),doi:10.1371/journal.pcbi.1000707,2010.
6.DanXie,JunCai,Na-YuChia,HuckH.NgandShengZhong.Cross-speciesdenovoidentificationofcis-regulatorymoduleswithGibbsModule:applicationtogeneregulationinembryonicstemcells.GenomeResearch,18:1325-1335,2008.
7.JianmingJiang,Yun-ShenChan*,Yuin-HanLoh*,JunCai*,Guo-QingTong,Ching-AengLim,PaulRobson,ShengZhongandHuck-HuiNg.AcoreKlfcircuitryregulatesself-renewalofembryonicstemcells.NatureCellBiology.10:353-360,2008.(*contributeequally)8.JunCai,YingHuang,FeiLiandYandaLi.Alterationofproteinsubcellularlocationanddomainformationbyalternativetranslationalinitiation.Proteins,62:793-799,2006.
9.JunCai,JingZhang,YingHuangandYandaLi.ATID:aweb-orienteddatabaseforcollectionofpubliclyavailablealternativetranslationalinitiationevents.Bioinformatics,21:4312-4314,2005.
科研项目：
1.国家自然科学基金委员会面上项目，31171265，“HeLa细胞中非整倍体基因组结构与肿瘤细胞适应性关系的研究”，2012.01-2015.12，在研，课题负责人;
2.国家重点基础研究发展计划项目，2012CB316505,基于新一代测序的生物信息学理论与方法,2012.01-2016.12，在研，主要学术骨干.