本专业硕士点设在电子商务与供应链系统市级重点实验室，专业代码：120100.
本专业硕士点现有：系统分析与优化、管理决策技术与方法、物流管理与工程、管理信息系统、工业工程、营销工程与服务管理、金融工程、房地产项目管理8个方向。
1、系统分析与优化
考察各类系统的关系和属性，揭示其活动和演化规律，探索系统评价和优化的各种理论和方法。其研究主要以应用数学（如最优化方法、概率论、网络理论等）、系统科学（如信息论、控制论、协同学、灰色系统论、可靠性理论等）、系统技术（如系统模拟等）为基础，结合经济学、管理学、社会学、心理学等学科知识，探索经济管理系统的分析和评价、自组织、优化和演化动力等的基础理论和方法，并针对社会复杂系统的建模及其组织管理开展理论和应用研究。
2、管理决策技术与方法
应用逻辑推理、定量分析、实证研究等科学方法研究决策科学理论，以及个体和群体决策者的决策行为，涉及决策理论、决策技术、决策方法、对策论、预测技术、决策支持系统等方面。主要关注不确定性决策问题的建模与分析、网络环境下的决策理论与方法、群决策理论与方法、定性与定量综合集成预测方法、复杂系统的优化与决策、复杂博弈问题的建模与分析等，同时关注灰色系统理论、粗糙集理论、可拓性理论、模糊数学等新理论和新方法的探索，以及相对于定量分析的质性研究及其应用。
3、物流管理与工程
主要研究物流系统优化和物流系统规划设计，涉及物流系统中的优化理论、方法及其应用，以及物流产业发展规划、区域物流活动的空间分布与规划设计。其研究主要以智能控制和系统仿真建模为基础，运用运筹学、智能优化与控制、系统仿真建模等理论与技术方法，对物流系统动态优化与仿真、自然灾害应急救援物流管理与优化等复杂问题进行智能控制与优化管理，并以物流学、管理学、区域经济理论和产业发展理论为基础研究区域或城市物流业发展、物流业结构升级、物流产业集聚和园区规划、物流发展战略与规划、区域物流发展、物流基础设施在资源空间配置中的规划与设计等。
4、管理信息系统
综合运用现代信息科学与技术、现代管理理论等知识，研究信息管理与信息系统规划、开发、集成、管理与控制中的科学问题与技术方法。本方向关注网络化环境下金融、医疗、教育、交通、商务、社会保障等各种行业和社会公共事务的信息化管理与辅助决策；重点针对支持高层决策、中层控制、基层运作的集成化人机系统中，信息的复杂性、可用性、海量数据的多维特征分析、数据挖掘、多元信息融合、多媒介信息识别与理解、信息安全、可信服务计算，以及“电子服务”的基础协同结构、业务模式、动态复杂系统建模、金融信息工程、智能搜索与在线体验等理论问题及其关键技术进行研究；以实现信息资源的充分开发、合理配置和有效利用，促进企事业单位和政府机构战略竞优、提高运行效率和运营效益。
5、工业工程
综合运用数学、物理、和社会科学的专门知识和技术，结合工程分析和设计的原理与方法，对对人、物料、设备、能源、和信息等所组成的集成系统及其所取得的成果进行确认、预测和评价。本方向关注信息化环境下工业工程理论和技术的需求分析、知识经济环境下制造业设备管理、可靠性工程及生产运作管理模式、面向高技术企业发展的人因工程与知识管理、面向工程建设的集成管理系统，以及新环境条件下的绿色制造、低碳技术、制造数字化、生产过程智能化和企业经营管理信息化等。
6、营销工程与服务管理
主要研究服务利润链的设计、评价和优化，服务的交互过程与交互质量，服务质量管理中的信息技术、营销定量分析技术、营销系统优化、商业模式变革等。本方向的重点是以现代服务环境下的商业和商务模式与企业组织系统优化和创新为对象，探索组织协调与组织进化、社会经济转型中的组织变革与发展、知识转移及创新机制设计、业务流程导向的知识管理系统设计、供应链系统的运行机制和合作机制、敏捷供应链管理系统及其Web技术实现、商业模式的演化与信息流管理、关系营销系统优化技术与合作关系质量、电子商务环境下的转移支付与金融服务、税收、物流、电子商务组织、虚拟团队、盈利模式及营销定量分析技术等。
7、金融工程
主要研究创新型金融工具与金融手段的设计、开发与实施，以及对金融问题给予创造性的解决，包括金融产品设计、金融产品定价、交易策略设计、金融风险管理等各个方面，本方向特别关注金融产品的设计与定价、动态资产组合理论与方法、风险价值和一致性风险度量的理论与方法、金融机构的风险管理，以及逐步开放条件下我国金融系统的复杂性和风险规避等问题。
8、房地产项目管理
主要运用系统的观点、理论和方法，对房地产项目的建设和使用进行全过程和全方位的综合管理，实现生产要素在房地产项目上的优化配置，为用户提供优质产品。它是一门应用性很强的综合性学科，也是具有很大发展潜力的新兴学科。本方向的重点在于项目建设全过程的管理，即从项目建议书、可行性研究、工程设计、工程施工到竣工全过程的管理。从性质上看，项目管理是固定资产投资管理的微观基础，其性质属投资管理范畴。房地产项目的各参与方都有自己的项目管理，可分为建设方的项目管理、开发商的项目管理、咨询方的项目管理、政府部门的项目管理等。
管理科学与工程是综合运用系统科学、管理科学、数学、行为科学和工程方法，结合信息科学与技术，分析、研究和解决社会、经济、工程等方面的管理问题的学科。
培养目标与要求为：学生通过专业系统的理论学习与实践，参与课题研究，获得较坚实的管理科学与工程的基础理论，较系统的专门知识；培养和树立严谨求实的科学态度和作风，具有创新求实精神和良好的科研道德，基本具备独立从事本学科的科学研究的能力，掌握一门外国语，能较熟练地进行专业阅读和初步写作；能正确地运用所学理论、方法和技术解决本学科领域的相关问题并有新的见解；培养具有健康的体魄，能够适应我国社会经济发展需要的高级管理专门人才，毕业后能够胜任本专业或相关专业的教学、科研以及相关行业和部门的管理工作。
开设的主要课程有：系统理论与方法、高级微观经济学、管理科学与工程前沿、管理研究方法论、高级运筹学、运营管理、应用数理统计、系统建模与仿真、物流与供应链管理、数据仓库与数据挖掘技术、金融工程学、灰色系统理论等。