港口、海岸及近海工程学科主要研究港口、航道及海岸工程的设计理论和建造技术。港口是水运交通的枢纽，经济建设、交通运输、海岸带和海洋的开发都与港口、海岸及近海工程学科紧密相关。随着世界经济国际化趋势的加强，港口建设和江河、海洋的开发利用将会有更大规模的发展。
我校港口、海岸及近海工程学科具有博士学位授予权，拥有国内一流的、中西部地区规模最大的水运工程教学和研究中心――重庆市水利水运工程重点实验室和重庆市航运工程技术研究中心，现为重庆市重点学科。本学科师资力量雄厚，现有教授7人，副教授25人，博士15人。
近年来，本学科完成了国家“九五”、“十五”科技攻关、三峡工程、国家自然科学基金等重大课题的研究，并获国家级科技进步奖和国家发明奖各1项，省部级科技成果和科技进步奖多项。在山区航道整治技术、内河港口码头设计理论、三峡工程通航技术、加筋土结构设计理论与应用技术、城市河岸整治方案研究等方面处于国内领先地位，部分研究成果达到了国际先进水平。